El MCP cuenta con un Plan de Mejora aceptado y asumido como compromiso por los miembros según Acta No. 02 del 21 de febrero 2020, con el objetivo de adecuar su funcionamiento y sus actividades a los requisitos de elegibilidad establecidos por el Fondo Mundial.
En el Plan de Mejoras del MCP Paraguay se detallan intervenciones para mejorar las competencias en Monitoreo Estratégico de las subvenciones, garantizar mayor representatividad de las poblaciones clave en la respuesta, y mejorar la gobernanza de esta instancia de articulación.